Сдаётся мне, это довольно-таки невыполнимая задача. Строить под водой дварфы не будут, как ты не пытайся - они не строят даже если клетка наполовину занята водой, что уж говорить про полностью заполненную. Опять же, даже если они у тебя амфибии, я сильно сомневаюсь, что Тоади предусмотрел подобную возможность, а, значит, глюков будет немеряно. Безусловно, ты можешь попытаться откачать воду, построить там что-нибудь, а потом перестать откачивать, вот только насосы в дф-е качают лишь на уровень вверх. Тебе придётся строить мега-насосную для откачки нескольких слоёв воды (мы же говорим о действительно подводной крепости, а не стеклянном потолке, покрытым одним кубом воды, правда?), да потом ещё, вероятно, её и перестраивать. А потом - разбирать, ибо подводная крепость с тонной насосов над ней - не комильфо.
Единственное, что мне лично приходит в голову - это подводная крепость в замерзающем биоме. Зимой назначай всех шахтёрами и быстро-быстро спиливай весь лёд, строй под ним что тебе нужно, а весной всё заполнится водой.
Ну и удачи, что
Похвались потом, как построишь